بیش از سه مرمتگر پس از بازدید میدانی از این بنای تاریخی ارزشمند، بندکشی با سیمان سفید در مدرسه خان را فاجعه مرمتی عنوان کردند و خواستار گزارش به وزیر میراث‌فرهنگی شدند تا دستور بررسی ابعاد این شیوه مرمتی را بدهد. به‌گزارش ایلنا، زهره بزرگمهری مرمتگر پیشکسوت کشور که از او در حوزه مرمت به‌عنوان چهره ماندگار نام برده می‌شود، در رابطه با وضعیت مرمت مدرسه خان گفت: هفته گذشته شیراز بودم با این‌که از اقدامات مرمتی درتخت‌جمشید وپاسارگادبسیارلذت بردم اما مرمت‌ بناهای تاریخی شیرازاصلا خوب نبود.در مدرسه خان نیز متوجه شدم که به اشتباه ملات زده‌اند و حتما باید اصلاح شود. مدرسه خان مهم‌ترین بنای تاریخی شیراز و متعلق به دوره صفوی است که لازم است با نوشتن نامه به وزیر میراث‌فرهنگی درخصوص مرمت‌های انجام شده، پیگیری‌ها در دستور کار قرار گیرد. استفاده از ملات‌های جدید مثل سیمان و ایزوگام در وهله نخست، بی‌تجربگی مرمتگر در مرمت بنای تاریخی را نشان می‌دهد و در درجه دوم سهولت دسترسی نسبت به این ملات‌ها است.