شیخ ابراهیم زكزاكی در سال ۱۹۵۳ میلادی در شهر زاریا در ایالت كادونا، شمال‌غربی نیجریه به دنیا آمد. او توانست سال ۱۹۷۹ در رشته اقتصاد از دانشگاه احمد‌بلو لیسانس بگیرد. زكزاكی از بدو ورود به دانشگاه فعالیت سیاسی خود را آغاز كرد و دبیركل انجمن دانشجویان مسلمان نیجریه بود. همزمان با وقوع انقلاب اسلامی ایران، شیخ زكزاكی كه به شدت تحت تاثیر رهبری امام خمینی(ره) قرار گرفته بود به ایران سفر كرد و پس از طی مراحل تحصیلی در حوزه‌های علمیه به كشورش بازگشت.
شیخ زكزاكی تاكنون چندبار به اتهام فتنه و اخلال در نظم عمومی زندانی شده است. در روز ۱۳ دسامبر ۲۰۱۵ بر اثر حمله ارتش نیجریه به حسینیه بقیه‌ا... و منزل، شیخ ابراهیم زكزاكی نیز تیر خورد و زخمی و توسط ارتش دستگیر و زندانی شد. سال 2016 دیوان عالی نیجریه حكم به آزادی شیخ زكزاكی داد اما تاكنون دولت نیجریه از اجرای این حكم
سر باز زده است.